水中SS颗粒大小、带电性都会影响混凝效果。一般来说，粒径细小而均一，其混凝效果较差，水中颗粒浓度低，颗粒碰撞机率小，对混凝不利；当浊度很大时，为使水中胶体脱稳，所需药耗将大大增加。

当水中存在大量有机物时，能被粘土颗粒吸附，从而改变了原有胶体颗粒的表面特性，使胶体颗粒更加稳定，将严重影响混凝效果，此时必须向水中投加氧化剂，破坏有机物的作用，提高混凝效果。水中溶解性盐类也能影响混凝效果，如天然水中存在大量钙、镁离子时，有利于混凝，而大量的Cl-，则不利于混凝。在汛期，因雨水的冲刷而导致含大量腐殖质的高浊度水进厂，一般采用的提高前加氯和混凝剂投加量正是基于此。